１９９９最終順位表
| 順位 | チーム名 | 90分勝 | 延長勝 | 負け | 引分 | 勝点 | 得点 | 失点 | 得失差 |
| 1 | 横浜ＦＣ | 16 | 2 | 3 | 3 | 55 | 57 | 32 | 25 |
| 2 | 本田技研 | 13 | 5 | 5 | 1 | 50 | 69 | 34 | 35 |
| 3 | 水戸 | 13 | 3 | 8 | 0 | 45 | 48 | 32 | 16 |
| 4 | デンソー | 8 | 3 | 9 | 4 | 34 | 46 | 38 | 8 |
| 5 | ソニー仙台 | 7 | 2 | 14 | 1 | 26 | 29 | 42 | -13 |
| 6 | 大塚 | 7 | 1 | 14 | 2 | 25 | 35 | 47 | -12 |
| 7 | ジャトコ | 6 | 2 | 13 | 3 | 25 | 40 | 53 | -13 |
| 8 | 横川電機 | 6 | 1 | 17 | 0 | 20 | 26 | 43 | -17 |
| 9 | 国士舘大学 | 4 | 2 | 18 | 0 | 16 | 36 | 65 | -29 |
水戸ホリーホック １９９９の軌跡
| 節 | . | 得点 | 失点 | 相手チーム | 競技場 | ホーム・アウェー |
| 1-1(4/18) | 水戸ホーリーホック | 4 | 0 | ソニー仙台 | 宮城サッカー場 | A |
| 1-2(4/25) | 水戸ホーリーホック | 0 | 3 | デンソー | 笠松陸 | H |
| 1-3(5/3) | 水戸ホーリーホック | 1 | 4 | 横浜FC | 三ツ沢球 | A |
| 1-4(5/9) | 水戸ホーリーホック | 1 | 2V | 本田技研 | 笠松陸 | H |
| 1-5(5/16) | 水戸ホーリーホック | 3V | 2 | ジャトコ | 愛鷹競技場 | A |
| 1-6(5/xx) | 水戸ホーリーホック | . | . | 試合無し | . | . |
| 1-7(5/30) | 水戸ホーリーホック | 1V | 0 | 横河電機 | 西が丘 | A |
| 1-8(6/6) | 水戸ホーリーホック | 1 | 0 | 国士舘大学 | 日立市民陸 | H |
| 1-9(6/13) | 水戸ホーリーホック | 0 | 1 | 大塚製薬 | 徳島サッカー場 | A |
| 2-1(6/20) | 水戸ホーリーホック | 2 | 1 | デンソー | 古河サッカー場 | A |
| 2-2(6/27) | 水戸ホーリーホック | 2 | 3 | 横浜FC | 愛川競技場 | A |
| 2-3(7/4) | 水戸ホーリーホック | 2 | 1 | 本田技研 | 日立市民陸 | H |
| 2-4(7/11) | 水戸ホーリーホック | 5 | 0 | ジャトコ | 愛鷹競技場 | A |
| 2-5(7/xx) | 水戸ホーリーホック | . | . | 試合無し | . | . |
| 2-6(7/25) | 水戸ホーリーホック | 1 | 0 | 横河電機 | 多摩陸上 | Ａ |
| 2-7(8/1) | 水戸ホーリーホック | 4 | 3 | 国士舘大学 | 笠松陸 | H |
| 2-8(8/8) | 水戸ホーリーホック | 1 | 0 | ソニー仙台 | 仙台スタジアム | A |
| 2-9(8/15) | 水戸ホーリーホック | 4 | 0 | 大塚製薬 | 笠松陸 | H |
| 3-1(9/15) | 水戸ホーリーホック | 4 | 1 | ソニー仙台 | 笠松陸 | H |
| 3-2(9/19) | 水戸ホーリーホック | 1 | 2V | 本田技研 | 都田サッカー場 | A |
| 3-3(9/25) | 水戸ホーリーホック | 2 | 1 | ジャトコ | ひたちなか陸 | H |
| 3-4(xxx) | 水戸ホーリーホック | . | . | 試合無し | . | . |
| 3-5(10/9) | 水戸ホーリーホック | 1 | 0 | 横河電機 | 笠松陸 | H |
| 3-6(10/17) | 水戸ホーリーホック | 2 | 3V | デンソー | 豊田陸 | Ａ |
| 3-7(10/31) | 水戸ホーリーホック | 2 | 0 | 横浜FC | ひたちなか陸 | H |
| 3-8(11/3) | 水戸ホーリーホック | 1 | 3 | 国士舘大学 | 西が丘サッカー場 | A |
| 3-9(11/7) | 水戸ホーリーホック | 3V | 2 | 大塚製薬 | 日立市民陸 | H |
水戸ホリーホック １９９９天皇杯の軌跡
| . | . | 得点 | 失点 | 相手チーム | 競技場 | . |
| １回戦(11/28)日 | 水戸ホーリーホック | 5 | 1 | ＴＤＫ秋田 | ひたちなか・総合 | Ｈ |
| ２回戦(12/5)日 | 水戸ホーリーホック | 2 | 1 | ベガルタ仙台 | 仙台スタジアム | Ａ |
| ３回戦(12/12)日 | 水戸ホーリーホック | 1 | 2 | 横浜Ｆマリノス | 三ツ沢競技場 | Ａ |
水戸ホリーホック １９９９の選手・監督
| . | 氏名 | . | 生年月日 | 身長 | 体重 | 前登録チーム | 出身地 |
| . | 二宮 浩 | 監督 | 1969/4/11 | . | . | 浦和レッドダイヤモンズ | 熊本県 |
| . | 柳田 伸明 | コーチ | 1970/12/5 | . | . | 富士通 | 東京都 |
| . | 川澄 和弘 | コーチ | 1970/10/5 | . | . | 藤枝ブルックス | 茨城 |
| １ | 松永 啓吾 | ＧＫ | 1976/5/18 | . | . | 順天堂大 | . |
| ２ | 山本 潮 | ＤＦ | 1972/7/10 | . | . | FCノーベント | . |
| ３ | 渡辺 卓 | ＤＦ | 1971/11/9 | 187 | 79 | コンサドーレ札幌 | 茨城県 |
| ４ | 横濱 誠 | ＤＦ | 1976/9/22 | 181 | 76 | 佐野日大高 | 栃木県 |
| ５ | 鳥羽 俊正 | ＤＦ | 1975/7/16 | 170 | 64 | 順天堂大 | 愛知県 |
| ６ | 八代 敏 (satosi) | ＤＦ | 1974/12/10 | 175 | 67 | 古河一校 | 茨城県 |
| ７ | 佐渡谷 聡 | ＦＷ | 1975/9/22 | . | . | ワールドサッカースポーツ | . |
| ８ | キシ・キクニ | ＤＦ | 1976/12/15 | . | . | ザイール （コンゴ民主共和国） | ザイール （コンゴ民主 共和国） |
| ９ | 田畑 雅行 | ＦＷ | 1972/4/3 | 171 | 66 | ＦＣ水戸 | 埼玉県 |
| １０ | 磯野 修久 (nobuhisa) | ＭＦ | 1974/1/8 | 175 | 72 | 横浜マリノス | 群馬県 |
| １１ | 金久保 好史 (yoshifumi) | ＭＦ | 1970/4/19 | 172 | 62 | 住友金属 | 茨城県 |
| １２ | 井本 喬士 | ＭＦ | 1976/9/29 | 172 | 65 | ＫＴめずらＳＣ | 佐賀県 |
| １３ | 野呂 直彦 | ＤＦ | 1975/5/1 | 168 | 65 | マインドハウス | 三重県 |
| １４ | 堀田 利明 | ＭＦ | 1975/4/29 | . | . | . | 栃木県 |
| １５ | 苫米地 賢一 (tomabechi) | ＦＷ | 1976/4/9 | 180 | 72 | 仙台大 | 大阪府 |
| １６ | 小原 光城 | ＤＦ | 1976/8/16 | . | . | 創価大 | . |
| １７ | 浦島 光雄 | ＤＦ | 1977/1/28 | . | . | . | . |
| １８ | 尾上 恵生 (sｈigeo) | ＦＷ | 1976/7/15 | 171 | 70 | 筑波大 | 大阪府 |
| １９ | 大谷 武大 (takehiro) | ＭＦ | 1980/12/6 | 170 | 62 | 常総アイデンティー | 茨城県 |
| ２０ | 窪木 孝次 | ＭＦ | 1975/11/24 | . | . | 東海大一高 | . |
| ２１ | 山本 優 | ＧＫ | 1975/11/24 | . | . | 佐川急便 | . |
| ２２ | 木山 隆之 (takashi) | ＤＦ | 1972/2/18 | 180 | 75 | コンサドーレ札幌 | 兵庫県 |
| ２３ | 中村 洋仁 (hirohito) | ＦＷ | 1974/5/9 | 177 | 74 | 本田技研 | 大阪府 |
| ２４ | 水野 淳 | ＭＦ | 1974/8/7 | 173 | 68 | ジェフユナイテッド市原 | 千葉県 |
| ２５ | 竹村 栄哉 | ＦＷ | 1973/12/6 | . | . | ベルマーレ平塚 | 広島県 |
| ３１ | 本間 幸司 | ＧＫ | 1977/4/27 | 185 | 85 | 浦和レッドダイヤモンズ | 茨城県 |
| . | . | . | . | . | . | . | . |
| ２５ | 大石 玲 | ＦＷ | . | . | . | . | . |
| ９ | 南 光太 | ＦＷ | 1975/5/1 | 170 | 63 | プロフェソール宮崎 | 大分県 |
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